萬善堂前身
早在19世紀末葉，英國差會—–倫敦傳道會已派宣教士來華傳道。1899年宣教士祈理信牧師和師母抵達廣州，於上西關西華路萬善里(後以此命名萬善堂)創立佈道所，先後有譚秉剛先生、梁偉持先生負責堂務。
不久地方不敷應用，遂於蘆荻西巷50號的舊庵堂園地，重新改建為禮拜堂，定名為中華基督教會萬善堂。1924年聖誕節舉行獻堂禮，1935年原職接生護士，其後獻身全職事奉的余博文姐妹擔任萬善堂女傳道一職，後由李胡秀珍姊妹接任。
31年李啟榮牧師被推舉出任中華基督教會東江區區牧，也是該會廣東協會東江區宗教教育幹事。萬善堂既屬於中華基督教會，李牧師須牧養萬善堂信徒。
33年春季李牧師就任堂牧，全心牧養萬善堂，他擅長全人關顧，既及靈魂，也及身體，受惠者眾，自此萬善堂日漸興旺，增長迅速。不但主日崇拜人數擠擁，而且開辦中小學及幼稚園、童光院(孤兒院)、即使在抗日年間，環境艱難，仍不斷贈醫藥、施粥飯、興學校、澤孤兒。
抗戰勝利，以至大陸政權易手，李牧師伉儷南來香港，萬善堂在廣州的聖工遂完成歷史責任，有待重現光彩。
復堂
1951年李牧師、師母南來香港在禮賢會事奉，54年離港赴美，既進修學業，又牧養北美華人教會。在美獲計志文牧師邀請擔任中國佈道會副會長，並於60年接受計牧師委任，回港重整中國佈道會文字出版事工(後發展成為聖道出版社)。
61年農曆元旦，在港萬善信徒響應李牧師號召，假香港禮賢會舉行團聚，與會者八十餘人，即席通過在香港恢復萬善堂。是年三月在李牧師領導下，購置濱海街48號3樓為基址。
10月8日正式加入成為中國佈道會其中一員，定名為基督教中國佈道會香港萬善堂，聘請朱建磯牧師及梁適岸姊妹為教牧同工。
62年11月25日敦請計志文牧師主禮，按立八位執事，協助教會成長。
發展
聖工蒙神恩領，會眾不斷增加，有需要擴堂，遂於1964年購得同街51、53號兩地舖為新堂址，並於是年12月12日舉行開幕感恩典禮，舊址作副堂及辦事處之用。除教會聖工外，利用地方開辦小學及幼稚園，以基督教教育教導學童。
64年3月正式加入香港基督教聯會為會員堂。
65年按立第一位長老，翌年再按立三位執事。由是香港萬善堂日益茁壯，教會大大蒙恩。
上帝不斷差派合祂心意的牧者來牧養信徒，又揀選長執配搭事奉，作神忠心的管家。
植堂 – 柴灣萬善堂
李牧師早有植堂心意，鑑於政府開發柴灣新市鎮，遂聯絡遷入柴灣居住的萬善信徒，於1967年1月展開柴灣徙置區佈道工作。先在家庭開始成人聚會，又在大廈梯間做兒童聚會，工作愈做愈大，需要有正式聚會場所。感謝 上帝，得該區福音學校借出校舍，開始主日下午崇拜。後購買滿華樓乙層作堂址，於72年5月啟用，正式定名為香港萬善堂柴灣堂。
20多年來，教會日漸發展，人數增加，地方不敷應用，加上樓齡漸高，經多番禱告等候，於 1998年蒙 主恩典搬離滿華樓，遷入發達中心現址，繼續發展聖工。及後有感教會漸趨成熟，於2001年向母堂申請獨立，並於同年通過有關申請，2002年本堂正式獨立並註冊成為有限公司，定名為基督教中國佈道會柴灣萬善堂有限公司。
柴灣萬善堂的Logo圖解如下:
